Una segunda temporada que nos acerca más a los personajes: la salida de Elle, la entrada de Emily Prentiss;ella habla ruso, español, árabe, italiano y castellano, también trata el secuestro, tortura y posteriormente, los problemas de Reid con el Dilaudid, el arresto de Morgan por asesinato y el homicidio de la amiga de Gideon, dejándo en él sentimientos de culpa, pero también de momentos jocosos y de suspenso, un sube y baja de emociones característicos de Criminal Minds.
Episodios
1. El rey pescador (parte 2)
20 sept 2006 41m 8.2El equipo sigue las pistas del psicópata que les amenaza con la intención de poder salvar a su última víctima. Gideon decide no centrarse en los aspectos personales del caso, y de hecho les pide que hagan el perfil del asesino como si estuvieran haciendo el de cualquier otro.
2. P911
27 sept 2006 41m 7.8Un chico que desapareció cuando solo tenía un año de edad aparece en una página de pornografía infantil para ser subastado. Un antiguo miembro de la UAC (Mary Page Keller) le pide al grupo que ayude en la investigación que intentará salvar al chico, antes de que su captor (David Pevsner) lo subaste y se dé a la fuga.
3. La tormenta perfecta
4 oct 2006 43m 7.8El BAU tiene motivos para creer que una serie de asesinatos pueden haber sido cometidos por dos personas trabajando como un equipo luego de que las familias de las víctimas reciben un DVD que incluye ataques psicológicos.
4. Psicodrama
11 oct 2006 41m 7.7El equipo es llamado para investigar una serie de robos a unos bancos tras ser evidente que el motivo no es el dinero. Dado que el ladrón (Jason Wiles) abusa de las víctimas haciéndoles desnudarse antes de abandonar la escena del crimen.
5. Secuelas
18 oct 2006 43m 7.6El equipo investiga a un violador que ha estado atacando a mujeres en colegios religiosos y que de repente ha parado por seis meses, para empezar a atacar a mujeres de más de 30 años. Durante la investigación Elle comienza a involucrarse demasiado emocionalmente, lo que la lleva a tomar una decisión que le podría poner fin de su carrera.
6. El hombre del saco
25 oct 2006 43m 7.8El equipo viaja a una pequeña comunidad en Texas para investigar los asesinatos de unos niños, que han sido muertos a golpes dentro del bosque que rodea la ciudad. Mientras, Elle y Hotch se quedan en Quántico resolviendo que hacer a continuación, luego de la investigación interna a la que se vio sometida Elle.
7. Pennsylvania
1 nov 2006 43m 8.0Un hombre secuestra a tres adolescentes y las encierra en una habitación. Les advierte que sólo pueden salir dos de ellas, por lo que tienen que elegir a cual mataran. El equipo coge el caso cuando una de las madres viaja a Quántico, para pedirle ayuda a JJ, antes de que sea muy tarde.
8. Planeta vacío
8 nov 2006 42m 7.9El equipo viaja a Seattle para identificar y cazar a un terrorista que se ha dedicado a amenazar a la ciudad con diversas bombas. Trabajarán mano a mano con un escritor de novelas de ciencia ficción que parece haber sido la inspiración del terrorista e intentarán determinar por qué elige esos objetivos.
9. La última palabra
15 nov 2006 43m 6.9La hija de un poderoso diplomático, Emily Prentiss, se une al equipo y tendrá que convencer a Gideon y Hotch de que se merece el trabajo basado en el mérito personal y no en las conexiones familiares.
10. Lecciones aprendidas
22 nov 2006 42m 7.8Gideon, Reid and Prentiss viajan a Guantánamo para interrogar al líder de una célula terrorista luego de que una aparato de dispersión de armas químicas es encontrado en una redada.
11. Sexo, nacimiento y muerte
29 nov 2006 43m 7.7El equipo es llamado a investigar los asesinatos seriales de prostitutas en Washington, D.C., y sospechan que un adolescente está detrás de los crímenes.
12. Analizador, analizado
13 dic 2006 42m 8.0Morgan es arrestado por asesinato cuando regresa a Chicago a visitar a su familia. Como el detective que realizó el arresto está utilizando un perfil diseñado por Gideon, el equipo viaja a Chicago para encontrar al verdadero asesino y exonerar a Morgan.
13. Sin salida (parte 1)
17 ene 2007 43m 8.2Gideon se deberá enfrentar al asesino más malvado y tenebroso de su carrera.
14. El gran partido (parte 1)
4 feb 2007 41m 7.8El equipo es llamado para investigar luego de que una adinerada pareja es asesinada en su hogar. El equipo persigue lo que ellos creen son varios asesinos que utilizan cámaras web para grabar y subir los asesinatos a la web.
15. Apocalipsis (parte 2)
7 feb 2007 43m 8.4En esta continuación del episodio anterior, encontrar al asesino se vuelve una misión crítica cuando el equipo se da cuenta de que Reid ha sido capturado por el asesino, y una grabación en vivo está disponible en internet.
16. Teme y odia
14 feb 2007 43m 7.5El BAU tiene que prevenir una posible revuelta racial cuando el asesinato de cuatro mujeres afro americanas en un suburbio neoyorquino parece ser parte de una serie de crímenes de odio.
17. Angustia
21 feb 2007 41m 7.6El equipo viaja a Houston para investigar una serie de asesinatos que han ocurrido cerca de sitios de construcción y edificios abandonados. Porque los asesinatos parecen ser al azar, el equipo considera que el sospechoso podría ser una persona sin techo.
18. Jones
28 feb 2007 41m 7.6Un caso de un asesino serial que imita a Jack el destripador lleva a Gideon a Nueva Orleans luego de que tres víctimas fueron degolladas.
19. Polvo y cenizas
21 mar 2007 43m 7.8Un pirómano serial que incendia las casas de familias de clase media alta mientras duermen es investigado. El equipo determina que las víctimas del pirómano tienen un vínculo en común.
20. Honor entre ladrones
11 abr 2007 42m 7.3Elizabeth Prentiss, la madre de Emily, busca la ayuda del BAU cuando un inmigrante ruso es secuestrado y los criminales piden un rescate.
21. Temporada de caza
2 may 2007 43m 7.9El BAU es llamado para investigar luego de que los cuerpos de varias personas desaparecidas son descubiertos en una región remota de Idaho. El terrible descubrimiento lleva al equipo a determinar que los sospechosos cazan humanos como deporte.
22. Legado
9 may 2007 42m 7.8Cuando varias personas sin hogar desaparecen de forma misteriosa, un detective llama al BAU para investigar las desapariciones.
23. Sin salida (parte 2)
16 may 2007 42m 8.5Cuando el prolífico asesino serial, Frank, regresa y asesina a la novia de Gideon, Gideon se embarca en una misión por atraparlo sin decirle al equipo hacia dónde se dirige. El BAU tiene que hacer el perfil de Gideon y de Frank para encontrarlos.